Industritorget använder cookies för att föra statistik samt hantera användning av siten. Genom att du fortsätter att använda vår sajt, samtycker du till att cookies används. - Läs mer OK
Detaljerad sökning

SENASTE NYTT

- Nyheter inom industrivärlden
Tipsa

Artificiell intelligens hittar sjukdomsrelaterade gener

Artificiella neurala nätverk kan användas för att hitta mönster i stora mängder data
Ett artificiellt neuralt nätverk kan hitta mönster i stora mängder genuttrycksdata och upptäcka grupper av sjukdomsrelaterade gener. Detta enligt en ny studie ledd av forskare vid Linköpings universitet, som publiceras i Nature Communications. Forskarna hoppas att deras tillvägagångssätt på sikt ska kunna tillämpas inom precisionsmedicin och individanpassad behandling.

I sociala medier är det vanligt att den tekniska plattformen ger dig vänförslag. Förslaget grundas på att du och den andra personen har gemensamma kontakter, och kanske därför också känner varandra. På liknande sätt kartlägger forskare biologiska nätverk som baseras på hur olika proteiner eller gener interagerar med varandra. Forskarna bakom en ny studie har nu tagit artificiell intelligens, AI, till hjälp och undersökt om det går att hitta biologiska nätverk genom att använda djupinlärning, det vill säga träna upp så kallade djupa artificiella neurala nätverk. Eftersom artificiella neurala nätverk är mycket bra på att lära sig att hitta mönster i enorma mängder komplexa data används de bland annat inom bildigenkänning. Men än så länge är det ovanligt att denna maskininlärningsmetod används inom biologisk forskning.

– I studien har vi för första gången använt djupinlärning för att hitta sjukdomsrelaterade gener. Det är en mycket kraftfull metod för att analysera stora mängder biologisk information, så kallad big data, säger Sanjiv Dwivedi, postdoktor vid Institutionen för fysik, kemi och biologi (IFM) vid Linköpings universitet.

Forskarna använde en stor databas med information om hur 20 000 olika gener uttrycks hos en stor mängd människor.

Informationen var osorterad, på så sätt att forskarna inte talade om för det artificiella neurala nätverket vilka genuttryck som kom från personer med sjukdom, och vad som var kopplat till friska personer. Sedan tränades AI-modellen i att hitta mönster i genuttrycket.

En av utmaningarna med maskininlärning är att människan inte kan se exakt hur ett artificiellt neuralt nätverk löser en uppgift. AI beskrivs ibland som en ”svart låda” – vi ser bara informationen som vi stoppar in i ”lådan” och resultatet som kommer ut, men inte stegen däremellan. Artificiella neurala nätverk består av flera lager där informationen bearbetas matematiskt. Det finns ett inmatningslager, ett utdatalager som levererar resultatet av AI-systemets bearbetning av informationen, och däremellan ett antal dolda lager där en mängd beräkningar utförs. När forskarna hade tränat det artificiella neurala nätverket, undrade de därför om de så att säga kunde glänta på locket till ”svarta lådan” och förstå hur det fungerade. Fanns det likheter mellan det neurala nätverkets uppbyggnad och de biologiska nätverk som redan är kända?

– När vi analyserade vårt neurala nätverk visade det sig att det första dolda lagret i stor utsträckning representerade interaktioner mellan olika proteiner. I det tredje dolda lagret däremot, djupare in i modellen, återfinns grupper med olika celltyper. Det är väldigt intressant att den sortens biologiskt relevanta grupperingar kommer ut per automatik när vårt nätverk har utgått från oklassificerat genuttrycksdata, säger Mika Gustafsson, universitetslektor vid IFM, som har lett studien.

I nästa steg undersökte forskarna om deras modell av genuttryck kunde användas till att avgöra vilket genuttryck som är kopplat till sjukdom och vad som är normalt. De fann stöd för att modellen hittar mönster som är relevanta och stämmer bra med de biologiska mekanismerna i kroppen.

Eftersom modellen har tränats på oklassificerad data kan det
artificiella neurala nätverket också ha hittat mönster som är helt nya. Forskarnas nästa steg är att undersöka om även sådana, hittills okända mönster, är relevanta ur ett biologiskt perspektiv.

– Vi tror att nyckeln för att komma framåt i forskningen inom fältet är att förstå det neurala nätverket. Dels kan det lära oss nya saker om biologiska sammanhang, exempelvis sjukdomar där många faktorer samspelar. Men vi tror också att vårt tillvägagångssätt ger modeller som lättare kan generaliseras och användas på många olika typer av biologisk information, säger Mika Gustafsson.

Genom nära samarbete med forskare inom medicin hoppas Mika Gustafsson kunna göra tillvägagångssättet i studien tillämpbart inom precisionsmedicin, för att exempelvis gruppera vilken patient som bör få vilken medicin eller vem som har svårast sjukdom.

Studien har finansierats med stöd av Stiftelsen för strategisk forskning (SSF) och Vetenskapsrådet.

Artikeln: ”Deriving disease modules from the compressed transcriptional space embedded in a deep autoencoder”, Sanjiv K. Dwivedi, Andreas Tjärnberg, Jesper Tegnér och Mika Gustafsson, Nature Communications, publicerad online 12 februari 2020, doi: 10.1038/s41467-020-14666-6, https://www.nature.com/articles/s41467-020-14666-6

För mer information, kontakta gärna:
Mika Gustafsson, universitetslektor, mika.gustafsson@liu.se, 013-28 21 38
2020-02-17 - Industritorget

SENASTE NYTT

- Nyheter inom industrivärlden
Tipsa

Skapa kompletta robotceller med 3D-CAD

20 240 41 7IRONCAD för effektivisering och automation

WTS Machinery ingår partnerskap

20 240 41 7Med Merlinum Forklifts

Komfort och ergonomi med Lännens grävlastare

20 240 41 7En inblick i Lännens engagemang för förarkomfort

EdmoLift belönas med silver i Ecovadisrankning

20 240 41 7Tilldelas silverrankning för hållbarhetsarbetet

Elpriser i realtid när

20 240 41 7ELLSY integrerar spotpriser från Nordpool

Hur påverkar additiv tillverkning hälsan

20 240 41 7Studie om hälsa och 3D-printning avslutad

Blekinge får nationell yrkesutbildning

20 240 41 7I industri och marin teknik

Svenska laddbolaget Waybler expanderar

20 240 41 7Genom nytt samarbetsavtal med Sparkli i Finland

Gör dig redo för fram­tiden med Evertiq Expo

20 240 41 7Sveriges elektronikindustri står inför utmaningar

Southco introducerar R4-50

20 240 41 7Ett nytt elektroniskt rotationslås med integrerad sensor

BigCommerce presenter­ar produktuppdatering

20 240 41 7BigCommerce lanserar över 100 nya funktioner

Nytt AI-verktyg ska öka lönsamheten

20 240 41 7I att återanvända IT-utrustning

TECEs nya Smart Home-system: energieffektivt

20 240 41 7TECE lanserar TECEfloor Smart Home på Nordbygg

Wästbygg Gruppen avyttrar logistikfastighet

20 240 41 7Erbjuda Niam attraktiva fastighetsförvärv

Byggelement öppnar ny fabrik

20 240 41 740 nya jobb och höga klimatambitioner

Trimble's connected For­est Management System

20 240 41 7Holmen embraces data-driven forestry with Trimble

Nordkoreanskt kopplad hotaktör

20 240 41 7Kartlägger måltavlor med ny slug taktik

Solita välkomnar Anders Hedfalk

20 240 41 7Expert och ansvarig för retaildomänen i Sverige

Dell integrerar Gaudi3 i PowerEdge-servrar

20 240 41 7Dell PowerEdge XE9680 med Intel Gaudi3-accelerator

BusinessBike blir Lease a Bike i Sverige

20 240 41 7Samma leasingprocess, nytt varumärke

Så här kan även du exportera till USA

20 240 41 6Effektiv flygfrakt

Tillverkning med hjälp av horisontal-svarvar

20 240 41 6I dessa lägen är horisontal-svarvar det bättre alternativet

Skydda fötterna på arbetsplatsen

20 240 41 6Förstå vikten av rätt skyddsskor

Exakt positionsbestämning

20 240 41 6Snabb statuskontroll av givaren

Ett nytt användarvänligt fallskydd

20 240 41 6Nytt fallskyddssystem med möjlighet för säker passage

Pålitlig temperaturav­läsning och övervakning

20 240 41 6Komplett guide till dataloggers för temperaturövervakning

Dachser förvärvar leverantören Brummer

20 240 41 6Logistikleverantören av temperaturreglerande livsmedel

Akamai lanserar molninfrastruktur

20 240 41 6Och tjänster drivna av NVIDIA

Nexer expanderar i Tyskland

20 240 41 6Med Giuseppe Gullo som landschef

Mingeldags på Nordbygg

20 240 41 6Plåt & Ventföretagen bjuder in till mingel

Persistent Data Network (PDN)

20 240 41 6Enkel och säkert sätt för industriell fjärrkommunikation

BOLIST Älvdalen

20 240 41 6En bygghandel i generationer

Dynatrace utökar samar­bete med Google Cloud

20 240 41 6Dynatrace och Google Cloud förbättrar samarbete

Få nyttjar AI för personlig marknadsföring

20 240 41 6Endast en av tio marknadsförare använder AI

Thomas Betong satsar på biogasbilar

20 240 41 6Minskad klimatpåverkan i fokus

Teknikprodukter genom åren

20 240 41 640 år av innovation och gemenskap

Miljondonation till forskartjänst

20 240 41 6Inom elektroniska mediciner

Skicka in pressmeddelande
Studenter hjälper energibolagen i Dalarna
20 240 41 6
Ny unik metod kan visa risk för hjärt-kärlsjukdom
20 240 41 6
14 aktörer ger 4%+ på rörliga sparkonton
20 240 41 6
Ökat intresse för att köpa företag i Sverige
20 240 41 6
En stigcyklists landsvägscykel
20 240 41 6
BE Group lanserar Salcos gröna konstruktionsstål
20 240 41 5
Utökad satsning på batteriutveckling
20 240 41 5
Inget mer kvicksilver i offentlig belysning
20 240 41 5
CERTEX hissar världens högsta trävindkraftverk
20 240 41 5
Ny era av skärmaskiner
20 240 41 5
Solcellsmätning och framtidens mätverktyg
20 240 41 5
Höj ribban med UGIMA®-X
20 240 41 5
Slitsad U-formad genomföring
20 240 41 5
Välj rätt tätningssats för din hydraulcylinder
20 240 41 5
ArmorKinetix distri­buerade servoenheter
20 240 41 5
Yale lanserar larm och kameror
20 240 41 5
H2Pro™ sealing materials for hydrogen
20 240 41 5
Framtiden för cirkulär elektronik
20 240 41 5
Jungheinrich får validering
20 240 41 5
AI spås som en av tre utmaningar
20 240 41 5
Företag prioriterar mjukvarudesign
20 240 41 5
Affären klar
20 240 41 5
De vanligaste orsakerna till visselblåsning
20 240 41 5
Träffa oss på Nordbygg!
20 240 41 5
Magnus Ericsson, Swerock
20 240 41 5
Toppkvalitativa grävlastare från Lännen
20 240 41 5
Varför långsammare stubbfräsar är bättre
20 240 41 2
Tuffa miljöer kräver tuffa märkningar
20 240 41 2
Vikten av rätt montering och kapsling av chip
20 240 41 2
Återvinn dina använda blybatterier
20 240 41 2
NYHET - Blixtljus 1570884
20 240 41 2
Skydda dig mot fall med rätt fallskydd
20 240 41 2
Bilvärderingsbolaget Go­Car tar marknadsandelar
20 240 41 2
Caroline ny Nordenchef för Capgemini
20 240 41 2
Generativ AI används av nätbusar
20 240 41 2
2024-04-12
BOLIST vill att fler lyckas med sina byggprojektHur kan organisationer maximera värdet av AI Mestergruppen behåller den ledande positionen Ökat cyberhotTryckkärl för industriellt bruk och deras betydelse
2024-04-11
Boxon i förarsätet Ständig incidenthante­ring och dåligt samarbete Kvantgenombrott 5G-router med inbyggt SIM-kortTransportfirma leder MC-återförsäljare till Europa
2024-04-10
4 fördelar med Maskinera auktionsförsäljningFördelar och funktioner för det nya vajersystemetSeiferts avfuktareNy STIHL produktions­anläggning i RumänienDåligt förberedda och övermodiga
2024-04-09
Upptäcka blixtsnabbt av­vikelser i era mätresultatTotal kabel- och kabelkedjelösningProblemfria timmar i nya hybridgrävarenLesjöfors först med SBTi-godkända klimatmålNytt från HEIDENHAIN
2024-04-08
Tre starka varumärken Nyhet! ENUX NordicMiljövänligt byggmaterial kan vinna forsknings-SMNu bildas Nordens ledande expert BOLIST Byggstart är tillbaka

För besökare

För medlemmar

Utökad annonsering

Digital medieproduktion

industritorget.se

Industritorget Sweden AB
+46 35 260 32 00
support@industritorget.se

industritorget.se | Sveriges mest besökta industrisajt